Wikipedia'dan: Modern çağda geçen hikaye, sadece normal bir hayat yaşamak ve bir Okonomiyaki restoranını miras almak isteyen Miharu Rokujou ile ilgili. Şu anda en büyük sorunu, bir Nindō (忍 道?, "Ninja Yolu") Kulübü kuran Kouichi Aizawa ve Durandal Thobari Kumohira'nın sürekli rahatsız olmasıydı. Miharu "ninjalar" ile hiçbir şey yapmak istemiyor ve her seferinde onları geri çeviriyor. Ancak kısa süre sonra gerçek bir ninjalar grubu tarafından saldırıya uğrar ve Kouichi ve Kumohira tarafından korunur. Orada, Miharu gizli ninja dünyası Nabari'yi, sınıf arkadaşı ve öğretmeninin o dünyadaki rollerini ve içindeki gizli sanat Shinra Banshou'yu (森羅 万象 Shinrabanshō?, Lit. "doğadaki her şey") öğrenir. Tüm dünyanın bilgisini içeren gizli sanat, Nabari'de şiddetle imreniliyor. Ve bu nedenle Miharu normal hayatına dönemiyor. Hayatta kalmak için "Nabari'nin Hükümdarı" olması gerekir. Baka-Updates'ten: Rokujou Miharu, kendi dünyasında yaşayan görünüşte isteksiz bir ortaokul öğrencisiydi. Ancak onun içinde Nabari'nin nihai gücü “Her Şeye Kadir” gizlendi. Iga'nın Kurt Sürüsü, böylesine üstün bir silaha sahip olmak için Miharu'yu Iga köyüne geri getirmeye yemin etti. Öte yandan, Miharu'nun İngilizce öğretmeni Kumohira sensei ve sınıf arkadaşı Kouichi, Miharu'yu korumak olan Banten ninjalarıydı. Böylelikle "Omnipotent" mülkiyeti üzerinden yürütülen bir savaş başladı. Miharu hayatta kalmak için kral olmak için gizli Nabari dünyasına girmelidir.
