(Yuuki Homura)

Yakın gelecekte, Japon bir bilim adamı, "Sonsuz Stratos" (IS) adı verilen güçlü bir dış iskeleti tasarladı. Diğer silah sistemlerinden çok daha gelişmiş teknolojiye ve savaş yeteneklerine sahip olan İD, dünyayı istikrarsızlaştırma tehdidinde bulunuyor. Böylesine güçlü bir silahla karşı karşıya kalan dünya ülkeleri, IŞİD'in asla askeri savaşta kullanılmayacağını ve herhangi bir ulusun hakimiyetini önlemek için mevcut IS teknolojisinin tüm uluslara eşit olarak dağıtılması gerektiğini belirten "Alaska Antlaşması" nı kabul etti diğerleri. Ancak IŞİD'in tanıtılmasının toplum üzerinde büyük bir etkisi var. IŞİD sadece kadınlar tarafından yürütülebileceğinden, kadınlar ve erkekler arasındaki güç dengesi bozuldu ve kadınlar topluma erkeklerden üstün geliyor.
IŞİD'in tanıtılmasından on yıl sonra, dünya yeni bir barış çağına girdi. Barış beklenmedik bir keşifle paramparça olur. Ichika Orimura adlı 15 yaşındaki Japon bir çocuğun bir IS'yi çalıştırabildiği keşfedildi. Potansiyelin farkına varan Ichika, Japon hükümeti tarafından dünyanın her yerinden IŞİD pilotlarının eğitildiği uluslararası bir akademi olan prestijli Infinite Stratos Academy'ye katılmaya zorlanıyor. Böylece kızlarla çevrili yoğun okul hayatı başlar.